近代消毒观念的形成和发展正是在兴起于西方的现代医学、微生物学、流行病学、化学、物理学等相关学科的发展中被逐步推进。
临床医学的需要是促使消毒观念诞生的关键因素。在医院消毒开展以前，各科疾病的病死率都很高。19世纪中叶，塞梅尔维斯对维也纳大学附院两个产科病房产妇的产褥热病死率进行了对比分析后，首创了临床医学消毒的范例。1857年，威尔士要求手术前必须严格消毒手和手术器械。李斯特采用石碳酸消毒创面、医生的手和器械，使骨折病人病死率大大下降，开外科消毒之先河。1880年基尔默出版了《现代外科抗菌伤口处理方法》，为外科手术消毒提供了理论和实践基础。临床医学的需要促进了医院消毒工作的开展，消毒工作的开展大大地降低了各科住院病人的病死率，提高了医疗质量和临床医生对消毒重要性的认识。
微生物学的发展为消毒学的形成提供了科学理论基础。19世纪下半叶，巴斯德等发现细菌，奠定了现代微生物学的基础。自此，医学界越来越多地寻求和描述细菌，短时间内便发现许多传染病的病原体和与疾病有联系的细菌。科赫在《创伤感染原因的研究》和《病原微生物研究》中，不仅阐述了各种细菌的形态和生物学特征，并介绍了灭菌方法。
流行病学的发展加速现代消毒观念的形成。流行病学是一门研究传染病的传染来源、传播途径及其预防的科学。1949年，苏联科学家格罗马舍夫斯基在其《流行病学总论》中，明确提出切断传播途径是预防和消灭传染病的三大要素之一。19世纪初，随着工业的发展，自来水厂兴起，早期的自来水只是把从江河中抽来的水送至工厂，供工业生产用的工业自来水，并不实施消毒。人们饮用工业自来水曾引起过无数次的霍乱、伤寒、痢疾等肠道传染病的水型爆发或流行。例如1892年汉堡霍乱水型爆发，仅登记的典型病人就达到17000余例。对自来水实施消毒处理后，在供应安全用水的城市，霍乱不再发生。饮水消毒在预防和消灭肠道传染病中起了巨大作用。作为切断传播途径重要措施的消毒，在其他方面还有食物消毒、空气消毒、日常用品消毒、医疗器械消毒、疫源地消毒等。
与此同时，物理学与化学新技术的发展为消毒方法的更新提供了有利条件。近30年来，随着物理学新技术开发，物理消毒技术有很大发展。电离辐射自1953年用于医疗器材的灭菌以来，由于辐射灭菌不使物品升温、穿透力强、方法简便且节约能源消耗，使用频率越来越高。预真空压力蒸汽灭菌器在实践中解决了压力蒸汽灭菌器中冷空气排除的问题，其蒸汽对被消毒物品的穿透快速，灭菌快，极大程度节约了人力、时间和能源。此外，微波消毒也是物理学技术开发、应用的成果。微波可穿透玻璃、陶瓷、塑料及纸张，热传导迅速均匀，物品可以在用上述材料包装密封以后进行灭菌。
化学消毒历史悠久，化学的发展为消毒剂的筛选和更新提供了丰富的资源。早在1806年，吉托·莫普沃在《论改善空气与防止传染的方法》一书中，就为空气消毒推荐了30余种化学物。18世纪末至19世纪间，化学消毒取得巨大成就。
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